В ВД два бассейна : большая и малая чаши. Большая чаша: 50×25 м (10 дорожек), глубина – 1,45м, единовременная пропускная способность – 150 человек. Малая чаша — 7×12 м, глубина -0,9м, рассчитана на занятия 22 человек одновременно. Самым юным посетителям меньше года, поэтому в малой чаше работает группа «мать и дитя». В водном дворце «Йошкар-Ола» применяются новейшие технологии в системе комбинированной очистки воды. Фильтрование и очистка производится гипохлоритом натрия и ультрафиолетом. В ВД имеется современный тренажерный зал, большой гимнастический зал, малый гимнастический зал, кафе, массажный кабинет, проводятся занятия по прикладному каратэ и самообороне. В перспективе открытие парикмахерской, косметологического кабинета, детской игровой комнаты.